Tak dipungkiri, Indonesia merupakan negara dengan biodiversitas yang tinggi dengan berbagai jenis ekosistem. Karst merupakan salah satu ekosistem yang unik dan terbentuk dari proses pelarutan batuan penyusunnya. Proses pelarutan yang terjadi secara konsisten akan menciptakan ekosistem baru berupa gua, sehingga karst memiliki dua lingkungan yakni di dalam gua (endokarst) dan kehidupan luar gua (exokarst). Lingkungan gua terbentuk di bawah permukaan tanah, cahaya matahari tidak dapat masuk sehinggga lingkungan ini relative gelap dan lembab. Batasan ini yang kemudian menjadikan linkungan gua unik, karena tidak semua oraganisme dapat hidup dan beradaptasi di dalamnya. read more

Identifikasi secara molekular merupakan metode yang akurat untuk identifikasi suatu individu. Salah satu gen mitokondria yang telah banyak digunakan untuk proses identifikasi ikan yaitu gen mitokondria COI (cytochrome oxydase subunit I). Gen mitokondria COI adalah salah satu gen penyandi protein yang terdapat di mitokondria dan bertanggung jawab pada langkah akhir fosforilasi sebelum pembentukan ATP, sehingga disepakati sebagai gen yang digunakan dalam DNA barcoding  (Zein dan Prawiradilaga, 2013). read more

Macrobrachium merupakan genus udang dengan anggota spesies terbanyak dalam familia Palaemonidae. Wowor et al. (2009) menyebutkan setidaknya ada 240 spesies dalam genus ini, dengan 100 di antaranya berada di Asia Timur dan Tenggara. Identifikasi morfologis pada anggota genus ini relatif sulit dilakukan karena karakter morfologis utama Macrobrachium bergantung pada keadaan lingkungan, perubahan dalam siklus hidup, jenis kelamin, dan dominansi sosial. Untuk itu diperlukan pendekatan lain untuk mengidentifikasi Macrobrachium secara akurat. Salah satu metode yang sedang dikembangkan adalah DNA barcoding menggunakan gen mitokondria 16S. read more

Indonesia memiliki luas lautan kurang lebih tiga juta kilometer persegi dan didalamnya terdapat kekayaan hayati yang sangat besar mulai dari ikan, terumbu karang, krustasea atau udang- udangan, moluska sebangsa kerang dan berbagai macam hewan laut lainnya. Dari beragam hewan tersebut, ikan menjadi salah satu hewan yang menempati berbagai habitat di lautan dari daerah pasang surut hingga laut dalam. Salah satu ikan yang hidup di laut yaitu ikan rockskipper atau biasa disebut ikan gelodok, dari berbagai macam jenis ikan rockskipper salah satu jenis yang ada di Pantai Porok, Gunungkidul, Yogyakarta adalah jenis Entomacrodus vermiculatus. read more

Sebagai negara kepulauan dengan iklim tropis, tidak dapat diragukan lagi bahwa Indonesia menyimpan kekayaan alam yang sangat tinggi. Mungkin beberapa dari kita yang senang menonton acara-acara travelling telah disuguhkan oleh keindahan alam Indonesia yang membuat turis lokal maupun asing berduyun-duyun mendatanginya. Namun, apakah kekayaan alam yang ada di negeri ini hanya terbatas pada bentukan dan pemandangan alam saja? Tentu tidak. Indonesia juga menyimpan kekayaan lain yang tidak kalah menarik, yaitu kekayaan hayati. read more